Los Órganos Autónomos son entidades que, sometidas al derecho administrativo y en dependencia de un Ministerio, realizan actividades fundamentalmente administrativas en régimen de descentralización funcional.
Los Órganos Autónomos son organismos públicos dependientes o vinculados a la administración que se rigen por el derecho administrativo.
Los Órganos Autónomos son entidades de derecho público, con personalidad jurídica propia, tesorería y patrimonio propios y autonomía en su gestión, que desarrollan actividades propias de la Administración Pública , tanto actividades de fomento, prestacionales, de gestión de servicios públicos o de producción de bienes de interés público. En el Gobierno del Estado de México los Órganos Autónomos son:
- Comisión de Derechos Humanos del Estado de México
- Fiscalía General de Justicia
- Instituto de Transparencia, Acceso a la Información Pública y Protección de Datos Personales del Estado de México y Municipios
- Instituto Electoral del Estado de México
- Tribunal de Justicia Administrativa del Estado de México
- Tribunal Electoral del Estado de México
- Universidad Autónoma del Estado de México